Dentro de la trama de Junjou Romantica se nos presentan tres parejas: La romantica la egoista y la terrorista.
La primera la romantica es la pareja protagonista y trata de la relacion entre el famoso novelista Usami Akihiko y el hermano menor de Takahiro su gran amigo de preparatoria y ex amor no correspondido, Misaki. A peticion del hermano de Misaki, Akihiko se hace el tutor de este para ayudarlo a entrar a la universidad su relacion comienza mal pero con el tiempo se van dando las cosas
La segunda es la egoista es formada por el amigo de infancia de Akihiko, Hiroki este estaba enamorado del escritor desde que eran pequeños a pesar de que no lo correspondio. Luego de casi romper la amistad que tenian Nowaki logra meterse en la vida de Hiroki al pedirle que sea su tutor.
La tercera es la terrorista es conformado por You y Shinobu, You es acosado por Shinobu el hermano de su ex esposa este le insiste en estar con el ya que le gusta pero Shinobu lo niega porque le dobla la edad.
